最近,面试头条,面试官一上来,就问了我这么一个问题,我一脸懵逼,决定记录一下。
给你1个文件bigdata,大小4663M,5亿个数,文件中的数据随机,如下一行一个整数:
6196302
3557681
6121580
2039345
2095006
1746773
7934312
2016371
7123302
8790171
2966901
...
7005375
现在要对这个文件进行排序,怎么搞?
先尝试内排,选2种排序方式。
3路快排:
private final int cutoff = 8;
public <T> void perform(Comparable<T>[] a) {
perform(a, 0, a.length - 1);
}
private <T> int median3(Comparable<T>[] a, int x, int y, int z) {
if (lessThan(a[x], a[y])) {
if (lessThan(a[y], a[z])) {
return y;
} else if (lessThan(a[x], a[z])) {
return z;
} else {
return x;
}
} else {
if (lessThan(a[z], a[y])) {
return y;
} else if (lessThan(a[z], a[x])) {
return z;
} else {
return x;
}
}
}
private <T> void perform(Comparable<T>[] a, int low, int high) {
int n = high - low + 1;
// 当序列非常小,用插入排序
if (n <= cutoff) {
InsertionSort insertionSort = SortFactory.createInsertionSort();
insertionSort.perform(a, low, high);
// 当序列中小时,使用median3
} else if (n <= 100) {
int m = median3(a, low, low + (n >>> 1), high);
exchange(a, m, low);
// 当序列比较大时,使用ninther
} else {
int gap = n >>> 3;
int m = low + (n >>> 1);
int m1 = median3(a, low, low + gap, low + (gap << 1));
int m2 = median3(a, m - gap, m, m + gap);
int m3 = median3(a, high - (gap << 1), high - gap, high);
int ninther = median3(a, m1, m2, m3);
exchange(a, ninther, low);
}
if (high <= low)
return;
// lessThan
int lt = low;
// greaterThan
int gt = high;
// 中心点
Comparable<T> pivot = a[low];
int i = low + 1;
/*
* 不变式:a[low..lt-1] 小于pivot -> 前部(first) a[lt..i-1] 等于 pivot -> 中部(middle)
* a[gt+1..n-1] 大于 pivot -> 后部(final)
*
* a[i..gt] 待考察区域
*/
while (i <= gt) {
if (lessThan(a[i], pivot)) {
// i-> ,lt ->
exchange(a, lt++, i++);
} else if (lessThan(pivot, a[i])) {
exchange(a, i, gt--);
} else {
i++;
}
}
// a[low..lt-1] < v = a[lt..gt] < a[gt+1..high].
perform(a, low, lt - 1);
perform(a, gt + 1, high);
}
/**
* 小于等于这个值的时候,交给插入排序
*/
private final int cutoff = 8;
/**
* 对给定的元素序列进行排序
*
* @param a 给定元素序列
*/
@Override
public <T> void perform(Comparable<T>[] a) {
Comparable<T>[] b = a.clone();
perform(b, a, 0, a.length - 1);
}
private <T> void perform(Comparable<T>[] src, Comparable<T>[] dest, int low, int high) {
if (low >= high)
return;
// 小于等于cutoff的时候,交给插入排序
if (high - low <= cutoff) {
SortFactory.createInsertionSort().perform(dest, low, high);
return;
}
int mid = low + ((high - low) >>> 1);
perform(dest, src, low, mid);
perform(dest, src, mid + 1, high);
// 考虑局部有序 src[mid] <= src[mid+1]
if (lessThanOrEqual(src[mid], src[mid + 1])) {
System.arraycopy(src, low, dest, low, high - low + 1);
}
// src[low .. mid] + src[mid+1 .. high] -> dest[low .. high]
merge(src, dest, low, mid, high);
}
private <T> void merge(Comparable<T>[] src, Comparable<T>[] dest, int low, int mid, int high) {
for (int i = low, v = low, w = mid + 1; i <= high; i++) {
if (w > high || v <= mid && lessThanOrEqual(src[v], src[w])) {
dest[i] = src[v++];
} else {
dest[i] = src[w++];
}
}
}
数据太多,递归太深 ->栈溢出?加大Xss?
数据太多,数组太长 -> OOM?加大Xmx?
耐心不足,没跑出来.而且要将这么大的文件读入内存,在堆中维护这么大个数据量,还有内排中不断的拷贝,对栈和堆都是很大的压力,不具备通用性。
跑了多久呢?24分钟。
为什么这么慢?
粗略的看下我们的资源:
内存 jvm-heap/stack,native-heap/stack,page-cache,block-buffer 外存 swap + 磁盘 数据量很大,函数调用很多,系统调用很多,内核/用户缓冲区拷贝很多,脏页回写很多,io-wait很高,io很繁忙,堆栈数据不断交换至swap,线程切换很多,每个环节的锁也很多。
总之,内存吃紧,问磁盘要空间,脏数据持久化过多导致cache频繁失效,引发大量回写,回写线程高,导致cpu大量时间用于上下文切换,一切,都很糟糕,所以24分钟不细看了,无法忍受。
private BitSet bits;
public void perform(String largeFileName, int total, String destLargeFileName, Castor<Integer> castor,
int readerBufferSize, int writerBufferSize, boolean asc) throws IOException {
System.out.println("BitmapSort Started.");
long start = System.currentTimeMillis();
bits = new BitSet(total);
InputPart<Integer> largeIn = PartFactory.createCharBufferedInputPart(largeFileName, readerBufferSize);
OutputPart<Integer> largeOut = PartFactory.createCharBufferedOutputPart(destLargeFileName, writerBufferSize);
largeOut.delete();
Integer data;
int off = 0;
try {
while (true) {
data = largeIn.read();
if (data == null)
break;
int v = data;
set(v);
off++;
}
largeIn.close();
int size = bits.size();
System.out.println(String.format("lines : %d ,bits : %d", off, size));
if (asc) {
for (int i = 0; i < size; i++) {
if (get(i)) {
largeOut.write(i);
}
}
} else {
for (int i = size - 1; i >= 0; i--) {
if (get(i)) {
largeOut.write(i);
}
}
}
largeOut.close();
long stop = System.currentTimeMillis();
long elapsed = stop - start;
System.out.println(String.format("BitmapSort Completed.elapsed : %dms", elapsed));
} finally {
largeIn.close();
largeOut.close();
}
}
private void set(int i) {
bits.set(i);
}
private boolean get(int v) {
return bits.get(v);
}
nice! 跑了190秒,3分来钟. 以核心内存4663M/32大小的空间跑出这么个结果,而且大量时间在用于I/O,不错。
问题是,如果这个时候突然内存条坏了1、2根,或者只有极少的内存空间怎么搞?
该外部排序上场了,外部排序干嘛的?
内存极少的情况下,利用分治策略,利用外存保存中间结果,再用多路归并来排序;
map-reduce的嫡系。
内存中维护一个极小的核心缓冲区memBuffer,将大文件bigdata按行读入,搜集到memBuffer满或者大文件读完时,对memBuffer中的数据调用内排进行排序,排序后将有序结果写入磁盘文件bigdata.xxx.part.sorted. 循环利用memBuffer直到大文件处理完毕,得到n个有序的磁盘文件:
现在有了n个有序的小文件,怎么合并成1个有序的大文件?把所有小文件读入内存,然后内排?(⊙o⊙)… no!
利用如下原理进行归并排序:
我们举个简单的例子:
文件1:3,6,9
文件2:2,4,8
文件3:1,5,7
第一回合:
文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行
文件2的最小值:2,排在文件2的第1行
文件3的最小值:1,排在文件3的第1行
那么,这3个文件中的最小值是:min(1,2,3) = 1
也就是说,最终大文件的当前最小值,是文件1、2、3的当前最小值的最小值,绕么?
上面拿出了最小值1,写入大文件.
第二回合:
文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行
文件2的最小值:2,排在文件2的第1行
文件3的最小值:5,排在文件3的第2行
那么,这3个文件中的最小值是:min(5,2,3) = 2
将2写入大文件.
也就是说,最小值属于哪个文件,那么就从哪个文件当中取下一行数据.(因为小文件内部有序,下一行数据代表了它当前的最小值)
最终的时间,跑了771秒,13分钟左右。
less bigdata.sorted.text
...
9999966
9999967
9999968
9999969
9999970
9999971
9999972
9999973
9999974
9999975
9999976
9999977
9999978
...
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