Shell是什么?
shell本身是一个命令解释器,介于操作系统的内核(kernel)和用户之间,可以执行系统调用及系统命令等,让用户以此来与操作系统实现互动。同时,它也用来指一种计算机程序语言(类似于C、Python/ target=_blank class=infotextkey>Python等)。一个shell程序一般被称为一个脚本。
Shell语言的流派
目前,shell主要有两大流派:
sh:
burne shell (sh) burne agAIn shell (bash)
csh:
c shell (csh) tc shell (tcsh) korn shell (ksh)
目前,大部分linux系统预设的shell都是bash。
Shell 编程概述
在 Linux 下有一门脚本语言叫做:Shell 脚本,这个脚本语言可以帮助我们简化很多工作,例如批量运行一些命令等,所以还是很有必要学习它的基本用法的,一个简单的 hello.sh 脚本像下面这样。
#!/bin/bash echo "Hello World!"
第一行 #!/bin/bash 标识该 Shell 脚本由哪个 Shell 解释:/bin/bash。将上面的两行内容写到文件hello.sh中,就可以执行了:
执行shell脚本方法1:
#这样可以省略第一行的:#!/bin/bash sh ./hello.sh
执行shell脚本方法2:赋予权限才可以执行:
# 赋予可执行权限 chmod a+x hello.sh # 执行 文件的第一行必须指定执行shell的路径:#!/bin/bash ./hello.sh # 结果 Hello World!
Shell 变量
Shell 变量分为 3 种:
定义变量需要注意下面 2 点:
使用 $ 符号调用变量,例如:
VAR="Hello Shell!" echo $VAR
注意:变量定义直接给变量取名字,变量值如果字符串中有空格等特殊字符需要用引号引起来,这样VAR变量中存储了一个字符串,再次调用变量的值需要加符号:$VAR
1. 用户自定义变量
支持字符串类型,浮点等类型,常见有这 3 个前缀:
注:可将上面内容存入一个sh结尾的文件中运行;
2. 预定义变量
预定义变量常用来获取命令行的输入,有下面这些:
一个例子:
执行./hello.sh 1 2 3 4 5 的结果:
3. 环境变量
环境变量默认就存在的变量,常用的有下面这几个:
还是看例子:
运行结果:
shell 语句
1. if 语句
这个跟高级语言的 if - else - if 类似,只是格式有些不同而已,也来看个例子吧:
2. for 循环
这是一个 for 循环基本使用例子,挺简单的,有点类似 Python:
运行结果:
3. while 循环
注意与 for 循环的区别:
运行结果:
shell命令应用:
其实我们打开的linux的终端也是一个shell,上面很多命令不用存到文件中也可以直接在终端运行;下面举例shell编程的运用;
1.利用循环批量生成命令,分别存储到不同的文件:
#注意:命令写成一行的时候用 ; 分隔不同语句块。 for i in xaa xab xac xad xae xaf xag xah xai xaj xak xal xam xan;do echo "perl /share/work/huangls/piplines/01.script/kegg_update_get_anno.pl $i $i.anno $i.fa" >$i.sh;done
2.利用循环批量修改文件名:
这里我想把下面文件名字中红色字符批量删除:(这里需要提前学习字符截取)
命令示例如下: